Genau das ist auch mein Problem mit Redmine, ich muss mich AFAIK durch dass Webfrontend "klicken".
Für Trac habe ich Skripte denen ich den Projektnamen und die LDAP-Gruppe übergebe, daraus wird dann eine Trac Instanz inklusive Apache Konfiguration und je nachdem ob das Trac+SVN oder das Trac+Git Script ausgeführt wurde ein passendes Repository inklusive Apache Konfiguration angelegt.

Für die nächsten Trac Versionen ist aber auch hier die Möglichkeit einer Multiprojekt-Instanz geplant, soweit ich weiß ist dass aber kein muss und ich kann weiterhin für jedes Projekt eine eigene Instanz erstellen.