FunionFS ist ein Union-Dateisystem für den FUSE-Treiber, das es erlaubt, kleine schreibbare Dateisysteme einem nicht schreibbaren Medium, z.B. einer CD, zu überlagern. Es ist nützlich für Live-CD-Distributionen oder Systeme, die Dateien in einem PROM oder einem komprimierten Dateisystem wie CRAMFS speichern.