ScalaBLAST ist eine Mehrprozessor-Implementation der NCBI-BLAST-Bibliothek. Sie unterstützt alle fünf primarären Programmtypen (blastn, blastp, tblastn, tblastx und blastx) und mehrere Ausgabeformate (paarweise, tabular und XML). Sie läuft auf den meisten Mehrprozessorsystemen, die MPI installiert haben, und läuft mit den verschiedensten Verbindungsarten, darunter Infiniband, Quadrics und Ethernet. Sie kann eine große Anzahl von Datenbankabfragen gleichzeitig ausführen. Sie parallelisiert die BLAST-Berechnungen, indem sie sie dynamisch über die Prozessoren verteilt mit einem Schema, das gegen Ausfälle weitgehend immun ist. (non)