FauBackup benutzt ein Dateisystem auf einer Festplatte für inkrementelle und volle Backups. Auf alle Backups kann auf einfache Weise mit den normalen Dateisystem-Tools zugegriffen werden. Spätere Backups auf das gleiche Dateisystem sind automatisch inkrementell, da unveränderte Dateien nur ein Link auf die existierende Version der Datei sind. (non)