Nutze Gentoo (testing-Zweig) seit 3 Jahren und kann mich bis dato nicht beschweren, dass es irgendwelche Probleme mit den Abhängigkeiten gab, die nicht binnen kurzer Zeit (weniger als 15 Minuten) gelöst waren.
Meiner Meinung nach, macht Gentoo es vor, wie man mit aktueller Software ein stabiles System hinbekommt.
Ein Ubuntu auf nahezu beugleichem PC versagte deutlich öfter. Es sind zweitweise einfach mal Programme abgeschmiert (Firefox, Amarok), dann blieb X hängen, Updates funktionierten nicht, usw.
Der notwendige Zeitaufwand, Ubuntu unter Kontrolle zu behalten ist meiner Meinung nach deutlich höher, als der eine Gentoo-Sytemes. Die Kompilierzeiten halten sich auf moderner Hardware auch im zeitlichen Rahmen bzw. können durchaus sehr bequem im Hintergrund laufen, ohne das System unbenutzbar zu machen. Sämtliche Updates liefen reibungslos.