Komisch, ich lese aus deinem Link heraus, dass jede Menge Code notwendig wäre, um die gleiche Funktionalität abdecken zu können. Dass ein Compiz-Teammitglied angeboten hat, Compiz so zu erweitern, dass es diese Schnittstellen mit abdecken kann, heisst ja nicht, dass das X-Protokoll alleine ausreichend ist.

Logische Konsequenz ist, daß künftig Anwendung X nur auf Deskop Y läuft.

Die logische Konsequenz jeder Art von Software-Entwicklung ist, dass Anwendung X nur läuft, wenn seine Abhängigkeiten erfüllt sind. Welche Abhängigkeiten benötigt werden, entscheiden die Entwickler jedes einzelnen Projektes. Die Benutzer entscheiden, welche Anwendungen sie nutzen wollen. Zu harte Abhängigkeiten können halt dazu führen, dass weniger Leute die Anwendung benutzen. Das ist mit xclock so, und mit Gnome Shell auch.