Miguel de Icaza scheibt in den Kommentaren zu seinem Blog, dass es derzeit drei Implementierungen gibt: keine Codecs (praktisch eine Art Dummyimplementierung), ffmpeg und Microsoft Codecs.

Ist natürlich schade, dass sie keine GStreamer Implementierung haben, vielleicht hat Systemintegration auch keine sehr hohe Priorität.

Die Kommentare zu den Blogs sind teilweise viel informativer als die Blogs ansich, weil eben auf spezielle Sachen eingegangen werden kann.
So betätigt Miguel auch ganz explizit, dass Microsoft kein Interesse an Gleichwertigkeit von Moonlight hat, bzw. noch nicht mal Gleichwertigkeit von Silverlight auf andere Betriebsystemen als Windows.