GObject nutzt du wahrscheinlich sowieso schon, da es z.B. von PulseAudio, PackageKit, PolicyKit und diversen distributionseigenen Tools benutzt wird. (GLib)
Wenn du jetzt eine GTK+-Anwendung installierts, die PyGObject benutzt, so wird nur noch GTK+ als Abhängigkeit installiert, also nicht mehr und nicht weniger als früher bei PyGTK. (Okay, vom GIR abgesehen, aber das sind auch nur wenige KB mehr)