Wo liegen die Unterschiede?
Der Fork behebt einige Fehler bei den Kommandozeilen und hat neuere hinzugefügt. Man kann detailierter angeben von wo welcher Stream mit welchen Filternm,... bearbeitet werden soll, das ganze für beliebig viele Quellen/Streams in einem Rutsch und zwar eindeutig und logisch nachvollziehbar.
Weiss nicht wie das aktuell bei ffmpeg ist aber das früher war das immer ein Krampf bzw. ging gar nicht.

Da jeweils das eine Projekt vom anderen neue Dinge übernimmt, nähern die sich m.V. nach wieder mehr aneinander an, so dass die (hoffentlich) wieder fusionieren.