Was beschwerst du dich, wenn du versuchst, ein Paket aus einer Quelle (Ubuntu) mit einem Paket aus einer anderen Quelle (Skype) zu ersetzen. Da garantiert dir keiner Kompatibilität zwischen den Quellen. Also sauberer Weg: Ubuntu Paket entfernen, Skype Paket installieren.

Zudem ist es durchaus vorgesehen, dass ein 32bit Binary auf einer 64bit Platform läuft. Skype hat das richtig gemacht und entsprechend die Abhängigkeit auf die 32bit lib gesetzt.