Kann man selbstverständlich beides einstellen, horizontal und vertikal. ;)

http://manpages.ubuntu.com/manpages/lucid/man4/synaptics.4.html

Option "VertTwoFingerScroll" "boolean"
Enable vertical scrolling when dragging with two fingers
anywhere on the touchpad. Property: "Synaptics Two-Finger
Scrolling"

Option "HorizTwoFingerScroll" "boolean"
Enable horizontal scrolling when dragging with two fingers
anywhere on the touchpad. Property: "Synaptics Two-Finger
Scrolling"

Gibt noch viele Spielereien mehr. Dazu lässt sich alles mit synclient zur Laufzeit modifizieren, aber Vorsicht! Besser die Startwerte (synclient -l) notieren, sonst wird am Ende evtl. alles viel schlimmer.