Ich denke da an gewisse Motif-Software (mittlerweile ist das meiste davon ja obsolet), in bestimmter Art und Weise auch der frühere Konflikt zwischen KDE & QT. Aber das bekannteste und aktuellste Beispiel dafür ist wohl Java, denn es gibt massenweise GPL-Javasoftware aber ein vollständiges, offenes Java-Enviroment gibts leider noch nicht.