Tja, dann gibts in deinem Fall wirklich nur die eine ungeliebte Lösung: nach Alternativen umschauen. Ich vermute allerdings wenn Du z.B. KDE/XFCE whatever benutzt, wird sich die besagte Anwendung auch nicht an den dort vorgenommenen globalen Einstellungen orientieren. Also: Anwendungsproblem.

Gruß, die Tendenz