E-Cell System ist eine objektorientierte Software-Suite für die Modellierung, Simulation und Analyse von komplexen Systemen wie biologischen Zellen. Sie erlaubt viele Komponenten, die von mehreren Algorithmen mit verschiedenen Zeitskalen gesteuert werden, gleichzeitig. Die Kernbibliothek ist in C++ geschrieben und verfügt über eine Python-Bindung. Die Frontend-Software verwendet Python.
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