Die Architektur des Frameworks folgt dabei dem Prinzip des Schichtenmodells für die Erstellung von Softwaresystemen. Aufbauend auf einer Drei-Schichtenarchitektur und der Befolgung des Dependency Inversion Principle entstehen mit JVx, einfach, wartbare Anwendungen. Das Framework bietet eine vollständige Unterstützung aller Schichten.