COPASI ist ein Programm zum Modellieren und Simulieren von biochemischen Netzen. Das Paket besitzt eine grafische Oberfläche, mit der man biochemische Netzmodelle definieren kann, indem man chemische Reaktionen und kinetische Gleichungen eingibt. Eine leistungsfähige Simulations-Engine kann dann Simulationen der Dynamik der Netze ausführen und viele verschiedene rechnerische Analysen vornehmen. COPASI kann die Dynamik simulieren, indem es entweder einen ODE-Ansatz oder einen stochastischen chemischen Kinetik-Ansatz (Algorithmen nach Gillespie) wählt. (non)