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  mkESA

mkESA ist ein Programm zum Konstruieren von verbesserten Suffix-Arrays (ESAs) aus biologischen Sequenzdaten. Das Programm beruht auf einer Implementation von Manzinis schlankem Deep-Shallow-Algorithmus, der auch mehrere CPUs nutzen kann, um höhere Geschwindigkeit zu erzielen. Die generierte Ausgabe ist mit der Ausgabe von mkvtree aus dem Vmatch-Paket kompatibel. (non)


 

Homepage: http://freshmeat.net/projects/mkesa/
Rating:
Lizenz: GNU General Public License Version 2 oder neuer
Kategorie: Konsole
 
 

.: Hauptzweig
2009-07-14  1.0.4  Keine Angaben  mehr...  
 
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