Backupninja ermöglicht das Ablegen einfacher Konfigurationsdateien in /etc/backup.d, um damit Systemsicherungen zu steuern. Es unterstützt auch Backups von anderen Rechnern und inkrementelle Dateisystem-, MySQL- und LDAP-Sicherungen. Zusätzlich zum Sichern normaler Dateien besitzt Backupninja Steuerungsmöglichkeiten zum Vereinfachen der Sicherungen von LDAP- und Mail-Verzeichnissen, MySQL, svn, trac und der Ausgabe von Shell-Skripten. (non)