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  intrinsic Noise Analyzer

iNA ist ein Werkzeug zur quantitativen Analyse von Fluktuationen in biochemischen Reaktionsnetzen. Solche Fluktuationen, auch als intrinsisches Rauschen bezeichnet, entstehen durch die stochastische Natur chemischer Reaktionen und können nicht ignoriert werden, insbesondere wenn einige Moleküle nur in sehr geringer Zahl vorliegen, wie zum Beispiel in lebenden Zellen. Die SBML-basierte Software berechnet statistische Größen wie Mittelwert und Standardabweichung der Konzentrationen sowie Variationskoeffizienten und Fano-Faktoren mit Hilfe der System Size Expansion (SSE). Das Ergebnis der Analyse kann gegen die numerisch sehr viel aufwendigere stochastische Simulation (SSA) getestet werden. (non)


 

Homepage: http://code.google.com/p/intrinsic-noise-analyzer/
Rating:
Lizenz: GNU General Public License Version 2
Kategorie: X11
 
 

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2014-03-13  0.4.3  Keine Angaben  mehr...  
 
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