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  PerlPrimer

PerlPrimer ist ein GUI-Programm, das Primer für Standard-PCR, Bisulfit-PCR Echtzeit-PCR (QPCR) und Sequenzierung entwirft. Es versucht, den Prozess des Primer-Designs zu automatisieren und zu vereinfachen. Features sind unter anderem Berechnung von möglichen Primer-Dimers, Holen von Genom- oder CDNA-Sequenzen von Ensembl (für QPCR automatisch beide Sequenzen), die Fähigkeit, mit einer BLAST-Suche auf dem NCBI-Server nach Primern zu suchen, ORF- und CpG-Inselerkennungs-Algorithmen, die Fähigkeit, Klon-Sequenzen zu Primern hinzuzufügen, automatisch angepaßt, um im Frame zu liegen, und QPCR-Primer-Design ohne manuelle Eingabe der intron-exon-Grenze. (hjb)


 

Homepage: http://perlprimer.sourceforge.net
Rating:
Lizenz: GNU General Public License Version 2 oder neuer
Kategorie: X11

Download:
http://perlprimer.sourceforge.net/download.html
Screenshots:
http://perlprimer.sourceforge.net/screenshots.html 
 

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2006-10-18  1.1.14  Geringfügige Korrekturen  mehr...  
 
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