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  mcl-edge

MCL-edge ist eine integrierte Kommandozeilen-gesteuerte Werkbank für die Analyse großer Netze. Sie enthält Programme für die Berechnung von kürzesten Pfaden, Durchmesser, Cluster-Koeffizient und einiges mehr. Ein Modul zum Laden und Analysieren von Genexpressionsdaten als Netz ist enthalten.

Der MCL (Markov Cluster Algorithm) ist ein schneller und skalierbarer Cluster-Algorithmus für Graphen, der auf stochastischem Fluß beruht. Der Flußprozess, der von dem Algorithmus eingesetzt wird, ist mathematisch fundiert und implizit an die Clusterstruktur in Graphen gebunden, die sich als der Abdruck zeigt, der von dem Prozess hinterlassen wird. (hjb)


 

Homepage: http://micans.org/mcl/
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Kategorie: Konsole

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