HapCluster++ ist ein Softwarepaket für »Linkage Disequilibrium Mapping« unter Verwendung der Coalescent-Theorie. Es beruht auf einer Bayes-Markov-Kette Monte Carlo (MCMC)-Methode zur Gen-Abbildung. Es ist eine C++-Implementation der Methode, die in dem Aufsatz »Fine Mapping of Disease Genes via Haplotype Clustering« von E.R.B. Waldron, J.C. Whitaker, and D.J. Balding. Genetic Epidemiology, 30: 170–179, 2006 beschrieben ist. (non)