Es gibt m.E. gute proprietäre Software unter Linux und zwei davon nutze ich täglich:

* Qoppa PDF Studio (es gibt meines Wissens nach kein vergleichbares Open Source Programm)

* Statistikprogramm Stata

Beide Firmen sind zudem sehr kooperativ bei Fehlern und Fragen, daher habe ich keine Bedenken.