SNPfile ist eine Bibliothek zum Bearbeiten von großen SNP-Datenmengen mit zugehörigen Metadaten, darunter Markierungsnamen, Markierungsorte, Phänotypen von Individuen usw. in einem bezüglich Ein- und Ausgabe effizienten Binärformat. Im Kern macht SNPfile sehr wenige Annahmen über die Metadaten, die mit Markierungen und Individuen verbunden sind, sondern überlässt das den Protokollen der Anwendungen. (non)