> Och, ich editiere öfter mal in meiner
> ~/.fvwm/.fvwm2rc herum oder zieh' mir
> irgendwelche Videos aus dem Mozilla- Cache
> raus, weil der Anbieter nicht möchte, daß ich
> die speichere; oder möchte ab und zu in
> meinen .wine- Ordner gucken ......

Das geht doch wunderbar, wenn man den entsprechenden Haken setzt (View->Show Hidden Files). Als Default wäre es ja wohl ziemlich schwachsinnig. Deine Fälle sind äußerst selten und selbst da stören die anderen ca. 40 Ordner nur (ich würde mir persönlich wohl (sichtbare) symlinks für .wine etc. setzen).
Konfigurationsverzeichnisse als Voreinstellung anzuzeigen ergibt für 99,9% der User keinen Sinn.