Es gibt eine Übersicht über die Programme die noch von den diversen "Altlasten" (Esound, Bonobo, usw.) befreit werden müssen bzw. was schon fertiggestellt wurde (Leider nicht 100% aktuell) :

http://www.gnome.org/~fpeters/299.html

Viele rote Einträge sind nicht mehr zu finden. Evolution z.B. ist schon Bonobo-frei (Seit ca. 2 Wochen, ist noch nicht in der Liste)

GNOME 3.0 wird meiner Meinung nach eher so etwas wie damals der Übergang von KDE 2 auf KDE 3 :

Man bereinigt die API, schmeißt Altlasten über Bord und bricht mit der Abwärtskompatibilität um wieder freier entwickeln zu können.